蒲瓜基因组组装和果实生长发育调控研究获进展

广东省农业迷信院蔬菜研讨所瓜类研讨一室与北京市农林迷信院研讨员左进华团队配合,在广东省农业迷信院科技翻新策略专项资金(高程度农科院建立)名目等的赞助下,研讨提醒了蒲瓜基因组构成跟退化关联及果实成长发育的分子调控机制。相干结果克日在线宣布于《园艺研讨》(Horticulture Research)。?蒲瓜又称瓠瓜、葫芦、夜着花等,属于葫芦科葫芦属,原产于非洲撒哈拉以南地域,现已在寰球多个地域普遍种植。作为我国北方地域主要的特点瓜类蔬菜,蒲瓜的幼嫩果实口感清新,养分丰盛,含有丰盛的维生素、胆碱、萜类跟黄酮等生物活性身分,存在潜伏的药用代价。但蒲瓜高品质基因组的缺少倒霉于其相干分子机制的研讨,妨碍了进一步的利用。该研讨经由过程联合PacBio HiFi、ONT超长读长测序跟Hi-C测序数据,胜利组装了蒲瓜的基因组,总长度为298.67 Mb。在11条染色体中,有7条实现了从端粒到端粒的无空隙组装,Contig N50到达了28.55 Mb,共解释出24,439个卵白编码基因。BUSCO评价表现,基因组的完全性到达了96.34%。经由过程基因组比拟跟体系发育剖析,发明蒲瓜与西瓜的亲缘关联近来,大概在14.3至32.38百万年前产生分化。该研讨还发明,赤霉素GA4跟Aux/IAA家属基因在果实的膨年夜跟成熟中起着介导感化。在细胞壁静态调控方面,XTHs跟EXPs酶类施展了主要感化;在果实发育的晚期阶段,重要以氨基酸跟脂质的积聚为主,然后期则以糖跟萜类化合物的积聚为主。GGAT2基因的表白程度与蒲瓜中谷氨酸的积聚浮现正相干性,而SUS5跟SPS4基因的表白程度与蔗糖积聚程度相分歧。该研讨成果为懂得蒲瓜基因组的退化以及果实成长发育的调控机制供给了主要的实践基本。相干论文信息:https://doi.org/10.1093/hr/uhae335   申明:新浪网独家稿件,未经受权制止转载。 -->
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